1 Globaalne

1.1 Uute nakatumiste arv

1.2 Uute surmade arv

1.3 Uued nakatumised, silutud liikuva keskmisega (k=3)

1.4 Uued surmad, silutud liikuva keskmisega (k=3)

1.5 Kumulatiivne nakatunute arv riigiti

1.6 Riikide epideemiad on alguspunkti järgi joondatud

Alla 100 kumulatiivse haigusjuhu on eemaldatud, et jooni paremini kohakuti saada.

1.7 Kumulatiivsed surmad: suurimad nakkuskolded

alla 5 kumulatiivse surma on pildilt eemaldatud, et jooni paremini kohakuti saada.

1.8 Kumulatiivne haigestumine: haigeid ja surnuid 100 000 kohta

Alla 20 kumulatiivse surma on pildilt eemaldatud, et jooni paremini kohakuti saada.

1.9 Suremine tormab testimisest mööda

1.9.1 Riskihinnangute konvergents 7-päevase nihkega andmete peal

2 Eesti võrdluses lähinaabritega (ja Gruusiaga)

2.1 Kumulatiivne nakatunute arv riigiti

2.2 Kumulatiivsed surmad

2.3 nakatumisi 100 000 elaniku kohta

2.4 surmi 100 000 elaniku kohta

3 mudeldamine eesti ja teised, riigi tasemel

3.1 viiruse kahekordistumisaeg saadud log2 skaalas kumulatiivse nakatumise tõusunurgast

R=1 jääb siin kuhugi 10-12 päeva vahele usutavasti. Riikides, kus viiruse topeldamiseks üle 12 päeva, võib kergemalt hinnata. Norras on see kuskil 12 ja Norrakad ise hindavad oma R=0.7 samal ajal. Eesti 10 päeva viitab, et R on enam-vähem 1.

4 3. Eesti

4.1 uued nakatumised värvitud maakonna kaupa

4.2 uued nakatumised tasandatud liikuva keskmisega

4.3 uued nakatumised maakonna kaupa

4.4 kumulatiivsed nakatumised maakonna kaupa

4.5 aktiivsed haigusjuhud (lag 8 päeva)

4.6 positiivsete testide osakaal

smoothed_frac = cases/tested igale päevale eraldi, silutud liikuva keskmisega.

cu_frac = cu_cases/cu_tested

4.7 nakatumiste tõusunurk log2 skaalas.

1 ühik = 2-kordne nakatunute arvu kumulatiivne tõus.

4.8 mudeldamine viimase kümne päeva põhjal

2-tasemeline shrinkage mudel log_cu_cases~days + (days|County)

4.8.1 nakkuse kahekordistumise aeg (päeva)

mean_days = 1/median(slope) posteeriorist high_days ja low_days on 90% CI posteeriorist.
Mean low high names mean_days high_days low_days
0.03 0.02 0.04 Hiiumaa 32.49 41.69 26.75
0.05 0.04 0.05 I-Viru 21.70 25.16 18.99
0.01 0.00 0.02 Järva 111.25 374.78 63.70
0.00 0.02 0.01 Jõgeva 923.41 66.67 126.60
0.00 0.02 0.01 L-Viru 795.85 66.67 127.12
0.00 0.02 0.01 Läänemaa 1013.13 66.67 130.68
0.05 0.04 0.06 Pärnu 20.11 23.28 17.71
0.03 0.03 0.04 Põlva 30.63 38.80 25.51
0.04 0.03 0.04 Rapla 28.15 34.48 23.77
0.02 0.01 0.02 Saaremaa 58.29 94.58 42.03
0.02 0.02 0.03 Tartu 41.43 56.26 32.51
0.03 0.02 0.03 Valga 35.91 47.56 29.26
0.02 0.02 0.03 Viljandi 43.58 61.25 34.02
0.01 0.00 0.02 Võru 103.58 338.16 60.46
215.63 204.61 224.17 lp__ 0.00 0.00 0.00